Запустить Apatana под Debian. Тут все или на Linux, или на Windows. Если прикрутите - можете тут описать как, или линк кинуть, если в нете найдете и прикрепим тему.
P.S.: Apatana 3 под Windows нормально работает? Это ж вроде как не релиз. Под Linux глючит ужасно.