Ерундой не страдайте. Какие бэкапы? (с)
У меня на всех компах и ноутах стоит Ubuntu 14.04. Диск разбит на три раздела: SWAP, / и /home. Под свап отдаю 2x RAM, под корень отдаю гигов 20, остальное под домашние каталоги. Такое разбиение помогает спокойно обновлять операционную систему, проверено при обновлении с 8, 10, 12-х убунт. Просто вставляете флешку со следующей версией Ubuntu и при разбиении дисков указываете, что надо использовать имеющиеся разделы, но домашний раздел форматировать нельзя, только подключить. Дальше всё ставится автоматом, а после загрузки вы получаете своё окружение без всякой настройки, всё работает, если вы не забыли установить свои программы из новой версии Ubuntu.
Если есть возможность, сделайте образ диска через dd.
Достаточно просто через tar скопировать содержимое нужных каталогов. dd слишком мощная утилита, ну зачем вам точная копия структуры каталогов?